Innovación en la vigilancia molecular de la malaria: Análisis comparativo entre novedosa prueba y paneles de microsatélite
Los investigadores Luis Cabrera, Joseph Vinetz, Dionicia Gamboa y Christopher Delgado publicaron el artículo «Comparing newly developed SNP barcode panels with microsatellites to explore population genetics of malaria parasites in the Peruvian Amazon» en la revista Frontiers in Genetics el 18 de diciembre del 2024 El estudio comparó la resolución genética de los novedosos códigos […]
Los investigadores Luis Cabrera, Joseph Vinetz, Dionicia Gamboa y Christopher Delgado publicaron el artículo «Comparing newly developed SNP barcode panels with microsatellites to explore population genetics of malaria parasites in the Peruvian Amazon» en la revista Frontiers in Genetics el 18 de diciembre del 2024
El estudio comparó la resolución genética de los novedosos códigos de barras de SNP (polimorfismos de un solo nucleótido), desarrollados previamente en los ensayos AmpliSeq (Kattemberg et al., 2023a; Kattenberg et al., 2024), con los paneles de microsatélites tradicionales para la vigilancia molecular de la malaria, analizando las poblaciones de Plasmodium vivax y Plasmodium falciparum en la Amazonía peruana.
Se evaluaron 51 muestras de Plasmodium vivax y 80 de Plasmodium falciparum recolectadas en tres localidades de Loreto, Perú. Ambos métodos mostraron resultados comparables en diversidad genética y estructura poblacional, destacando un agrupamiento geográfico marcado en Plasmodium falciparum en Nueva Jerusalén. Además, los paneles de microsatélites detectaron una mayor proporción de infecciones policlonales en Plasmodium vivax que los códigos de barras de SNP (69% frente a 33%, p = 3.3 × 10⁻⁵). En el caso de Plasmodium falciparum, ambos métodos identificaron proporciones similares (46% frente a 31%, p = 0.21).
Los resultados resaltan que la elección entre microsatélites y códigos de barras de SNP debe basarse en los objetivos específicos del estudio, los recursos disponibles y los costos, subrayando la utilidad de ambas herramientas para fortalecer la vigilancia molecular de la malaria.
¡En el IMTAvH estamos muy orgullosos de la publicación de nuestros investigadores!
Autores del estudio: Luis Cabrera, Mahdi Safarpour, Johanna Kattenberg, et al.
DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2024.1488109
Enlace del artículo: https://www.frontiersin.org/journals/genetics/articles/10.3389/fgene.2024.1488109/full
